DSH Research Kit

面向 DeepSeek Harness 的科研工作流目录与启动器：65 条人工审核的工作流、8 个技能指导模块、55 个科学数据源。

把反复执行的科研任务（审稿、写引言、做综述、设计分析计划）变成参数化、可编辑、发送前可见的提示词。插件只负责把任务组装好并交还当前会话，执行仍由你自己的 DSH Agent 完成。

前置：什么是 DSH

本项目是 DeepSeek Harness（命令行缩写 dsh）的插件。DSH 是 DeepSeek 开源的本地 Agent 工作系统，核心设计理念是「一切皆插件」（Everything is a Plugin）——模型、工具、界面、存储都由可替换的插件组成。

没有 DSH，本插件无法运行。 它不自带模型、不启动独立服务，只是在 DSH 的会话界面里增加科研入口。

需要什么	去哪拿
DSH 本体	deepseek-ai/deepseek-harness · 官方站点
插件生态	GitHub topic: dsh-plugin
Node.js	`>= 22.6`

DSH 目前处于 Developer Preview，官方明示会快速迭代、可能出现破坏性变更。本插件依赖的 conversation.view 槽位与 inputActions 契约随 DSH 版本演进——升级 DSH 后请按手工验收清单复验。

通用聊天输入适合临时提问，但不适合反复执行有明确步骤、材料要求与质量边界的科研任务。审稿、写引言、做综述、设计分析计划这类任务需要四件事：

分区	层	作用
资源与工作流	发现	目录检索、参数化组装、公开数据源直查
方法工坊	构造	方法卡 + 变量填充 → 可编辑 Prompt；可从当前对话提取草稿
研究资产库	沉淀	灵感资产增删改、版本对比、验证状态跟进；证据库子模块逐条保存公开来源的元数据与笔记，按项目隔离去重
研究证据图谱	证据	把本会话的资源、工作流、查询来源、资产与已保存证据连成可追溯关系；支持缩放平移、迷你地图、聚焦/上下游/两点路径模式与脱敏快照导出

分类	工作流（65 条）
论文与手稿（13）	审阅论文、撰写引言/方法/结果/讨论、撰写摘要、润色手稿、撰写审稿回复、期刊格式化、引文核验与修正、投稿信、稿件翻译、补充材料
文献研究（12）	文献综述与研究空白、文献检索、论文结构化导读、论文对比分析、系统综述方案设计、研究版图扫描、引文模式分析、公开数据集检索、研究趋势追踪、预印本快报、方法学对比、研究数据源选择
基因组学（22）	bulk RNA-seq 差异表达、单细胞全流程、变异检测、GWAS、变异注释与 ACMG 解读、基因集富集、调控网络、比较基因组、宏基因组、系统发育、表达图谱、甲基化、ATAC-seq、ChIP-seq、基因组注释、RNA velocity、空间转录组、细胞类型注释、轨迹拟时序、多组学整合、免疫画像、标志物发现
临床研究（5）	患者队列分析、病例对照分析、纵向数据分析、电子病历数据分析、风险预测模型（均标注"研究草案——非临床用途"）
数据分析（11）	设计统计分析计划、探索性数据分析、数据清洗方案、结果复现核查、统计审查、图表一致性核查、统计分析执行、Meta 分析、生存分析、回归建模、方差分析
研究设计（2）	样本量与统计功效估算、研究计划撰写

访问	用途	说明
当前会话输入框	仅在点击「写入/发送」时写入或提交最终 Prompt	不拦截 Enter，不自动发送，不改动其他会话历史
`@文件` 引用	只提示你使用 DSH 原生提及	不读取、不上传、不解析文件内容
浏览器本地	收藏、使用历史、方法卡与灵感资产（`localStorage`）	不存参数值、完整 Prompt、文件内容；清除浏览器数据即清空
浏览器 IndexedDB	证据库条目：来源元数据与你主动写下的笔记	仅在你逐条确认保存后写入；不保存全文、检索词与原始响应；按项目隔离，可导出 / 导入 / 彻底删除。证据图谱只展示其中的来源库 / 标识符 / 核验状态，不展示笔记
当前页面内存	本会话证据索引（已启动工作流、直查来源摘要）	仅供工作台各分区实时形成证据图谱；刷新或关闭页面即清空，不保存检索词、原始文件或完整结果
网络	公开数据源直查（仅在你主动触发时）	出网经 DSH 受控 web 服务；插件不持有任何 API Key

文档	内容
docs/README.md	文档索引与推荐阅读顺序
架构与数据契约	模块职责、数据流、DSH 宿主边界、目录 schema
开发指南	本地启动、实现顺序、测试策略、交付检查单
手工验收清单	为什么不能用单测替代、逐项验收步骤、失败定位树
方法工坊嵌入设计	vendored 工件治理、命名空间纪律、构建器集成规则
范围与边界	要解决的问题、产品边界、质量与安全原则