dsh-science

面向 DeepSeek Harness 的 Claude Science 式科研工作台 —— 面向基因组 / 病原体 / 人类健康 / 生物信息项目。

一句话介绍：dsh-science —— 面向 DSH 的 Claude Science 式科研工作台：ReAct 研究循环引擎（research_* 工具）、带溯源的版本化工件（artifact_* 工具），以及面向基因组/病原体/生物信息的 10 个科研技能。

• ReAct 研究循环引擎 —— research_init / research_state / research_hypothesis / research_experiment / research_findings / research_phase / research_review，状态持久化在 research-manifest.json（提问 → 假设 → 实验 → 观察 → 分析 → 结论 → 下一问题）。
• 版本化工件与溯源 —— artifact_save / artifact_list / artifact_show / artifact_reproduce：结果存为 artifacts//v/，附每文件 SHA-256、artifact.json 溯源（命令/输入/备注/环境）与追加式 provenance.md。
• 10 个科研技能 —— research-loop、science-project-setup、artifact-provenance、scientific-reviewer、literature-connector、parallel-delegation、manuscript-writing、bioinformatics-toolkit、conda-environments、data-inventory。

两个引擎插件零第三方依赖（只用 Node 内置模块），注册标准 cordis 工具。 既可作 profile bundle 安装（dsh plugin add），也可作 agent preset（「科学模式」）安装。

安装

方式 A —— profile bundle（社区标准）

dsh plugin --profile web add dsh-science            # npm 发布后
# 或直接从 GitHub：
dsh plugin --profile web add "github:biociao/dsh-science"

重启 profile（或刷新 Web GUI）。bundle 会把两个引擎插入 profile 层栈， 该 profile 上所有 agent 都能用 research_* / artifact_* 工具。

方式 B —— agent preset（完整「科学模式」，按 agent 隔离）

git clone https://github.com/biociao/dsh-science ~/.dsh/.agent-presets/science
# 或本地安装：
bash scripts/install.sh          # 复制安装（或：bash scripts/install.sh link）