Hongcheng-LI/dsh-scientific--plugins-gromacs ↗★ 0
dsh-gromacs
GROMACS molecular dynamics tools for DeepSeek Harness (skeleton: tools planned, see README)
安装
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npx -p @deepseek-ai/dsh dsh plugin --profile web add github:Hongcheng-LI/dsh-scientific#f0b39d7055539ba8e07baa75a0c1b57263e1b1dc&path:plugins/gromacs说明文档
阅读完整 README ↗dsh-gromacs — GROMACS 分子动力学(规划中)
⚠️ 骨架插件:框架已就位(包结构 / cordis 注入行 / 构建配置),工具尚未实现,安装后不注册任何工具、不影响 DSH 启动。
规划的工具
| gmx_version | 探测 GROMACS 可用性与版本 |
| gmx_run | 子命令白名单执行(pdb2gmx→…→mdrun→分析),stdin 应答交互选择 |
前置条件(实现后生效)
本机安装 GROMACS 并 source GMXRC,gmx 在 PATH 或配置 binary 绝对路径。
配置
见 cordis.patch.yml 内注释(binary 绝对路径 / 超时)。